Pokud jde o zabezpečení VoIP, společnost 3CX určuje standard. Vestavěné zabezpečení 3CX bylo vyvinuto výhradně pro ochranu systému PBX před útoky.

• Zvýšená konfigurace zabezpečeného webového serveru
• Automatická detekce a zařazení na černou listinu útočných nástrojů SIP
• Automatická aktualizace globální černé listiny IP pro zúčastněné pobočkové ústředny
• Provoz do aplikací 3CX je šifrován prostřednictvím tunelu 3CX.
• Hlasový provoz je šifrován pomocí SRTP
• Automatické generování a správa certifikátů SSL
• Revoluční zabezpečení VoIP s hodnocením A+ od laboratoře SSL
• Automatické převzetí služeb při selhání pro okamžité zálohování
• Šifrování mezi prohlížečem a webovou stránkou zajištěné pomocí protokolu HTTPS
• Omezení přístupu ke konzole pro správu 3CX na základě IP adresy